重庆cDNA合成逆转录酶测序

M-MLV反转录酶比AMV反转录酶缺乏连续性，因此要获得像AMV反转录酶反应中产生同样量的cDNA就要求使用较多单位的M-MLV反转录酶。用1微克的mRNA起始合成首先条链的cDNA，要用8单位的M-MLV反转录酶才相当于1单位的AMV反转录酶的作用。该酶很容易被亚精胺(Spermidine)所抑制，该酶非常不能用Promega的RiboprobeAMV反转录酶5X反应缓冲液，也不能用Promega的RiboclonecDNA首先条链缓冲液，因为这二种缓冲液均含有亚精胺。逆转录实验可以选择加入RNA合成抑制剂RNAse防止RNA降解和污染，逆转录实验过程需适当的RNA质量，过少或质量不佳将影响扩增效果。逆转录技术可以进行从RNA到DNA的转化，从而保护RNA序列的完整性。重庆cDNA合成逆转录酶测序

RNA逆转录实验注意事项：去除基因组DNA污染：残留的基因组DNA(gDNA)会对荧光定量结果造成很大的干扰，为了使结果更加的真实、可重复，我们需要去除gDNA干扰。我们可以在引物设计时避免gDNA的扩增，比如将上下游引物分别设在不同的外显子上；或者在提取RNA后使用DNaseI处理以除去gDNA。较后，我们还有非常法宝，选择一款具有gDNA去除功能的逆转录试剂盒，一步到位去除gDNA，省心省力max。RNA逆转录实验注意事项：逆转录酶热稳定性：逆转录酶在整个反转录体系中具有关键性影响。除了活性以外，逆转录酶的热稳定性同样很重要，在较高温度下进行逆转录，能够减少RNA的二级结构，增加逆转录的效率。野生型的M-MLV逆转录酶很“怕热”，高于37℃时，稳定性大幅下降。杭州加尾法逆转录稳定性高逆转录后的DNA可直接用于基因克隆或测序等应用。

逆转录的过程与端粒复制，逆转录酶通常具有多种活性，如逆转录活性、复制活性与RNA酶H活性。逆转录活性可以RNA为模板，合成与其序列互补的DNA链，生成DNA-RNA杂合双链。RNA酶H活性可以水解杂合双链中的RNA，得到与RNA互补的DNA单链（cDNA）。复制活性则用来合成双链DNA。HIV逆转录酶的活性部位。与复制类似，逆转录也是由5’向3’合成DNA，要求有模板和不少于四个核苷酸的引物。各种DNA聚合酶活性都需要引物，只有确认引物正确配对，才会进行DNA的合成。这是保证其忠实性的重要手段，逆转录酶也不例外。实验室合成cDNA时，经常会用合成的寡聚T（oligodT）作为引物，与mRNA的polyA配对。这个过程比较简单，因为引物结合在RNA链的末端，所以整条链的逆转录是一次性完成的。

逆转录实验的准备工作：1、实验器具与材料：（1）移液头：200ul、10ul；（2）吸头：200ul、20ul；（3）EP管1。5ml、100ul；（4）水浴箱。2、实验器具的处理与准备，塑料制品：（包括吸头、EP管等）将塑料制品逐个浸泡于1‰DEPC水中（必要时小头头需要用吸管打入DEPC水）37℃过夜，然后送至高压3次，后在80℃烘烤箱中烘干（或置于37℃中8小时左右烘干），试验前将头头放入吸头台。3、试剂配制和准备：（1）DEPC水：泡实验器具的DEPC水的配制：1000ml双蒸水中加1mlDEPC，放在1000ml容量瓶中静置4小时后备用。逆转录中所用的DEPC水的配制：100ml盐水瓶内装40ml双蒸水，加40ulDEPC，37℃过夜，送至高压，后分装到几个1。5mlEP管中，-20℃中保存备用。（2）RT中所需要的各种试剂。逆转录反应首先需要逆转录酶的反应活性。

逆转录酶是存在于RNA病毒体内的依赖RNA的DNA聚合酶。RT-PCR实验中的逆转录酶需要具有以下二种活性：依赖RNA的DNA聚合酶活性：以RNA为模板合成cDNA的首先条链。依赖DNA的DNA聚合酶活性：以一条DNA链为模板合成互补的双链DNA。在选择逆转录酶时，建议选择无RNaseH①活性（RNaseH-）的逆转录酶。具有RNaseH活性的逆转录酶的RNaseH活性会与聚合酶活性竞争RNA模板与DNA引物（或cDNA延伸链）形成的杂合链，并降解杂合链中的RNA链。被RNaseH活性所降解的RNA模板不能再作为合成cDNA的有效底物，降低了cDNA合成的产量与长度。逆转录实验过程中要使用干燥无菌的管头和标本采集器避免受外界污染。杭州加尾法逆转录稳定性高

酵母菌逆转录酶是逆转录酶家族中的一个重要表示。重庆cDNA合成逆转录酶测序

逆转录酶实验流程：从细胞材料中提取RNA→RNA加入到含有逆转录酶、引物、dNTPs的反应体系中→退火，引物与RNA链配对→延伸，逆转录酶合成互补cDNA链变性→常规PCR反应流程（变性、退火、延伸，如此多次循环）。RT-PCR“两步法”与“一步法”RT-PCR的实验操作分为“一步法”与“两步法”两种。一步法RT-PCR能克隆微量mRNA而不需构建cDNA文库（即cDNA合成与PCR反应在同一Buffer及酶中进行，一步法完成），省略了cDNA与PCR之间的过程。两步法RT-PCR首先用反转录酶合成cDNA，然后以cDNA为模板进行PCR，即RNA反转录与PCR扩增分两步进行。重庆cDNA合成逆转录酶测序